Magentoではさまざまな支払い方法を設定することができます。
メインメニューのシステム-セールス-支払方法とすすみます。
このタブの数だけデフォルトで用意されています。（一番上のCash on Deliveryはエクステで後から入れています）
クレジットカード決済をするならPaypalとAuthorize.netがデフォルトで用意されています。
Magentoは日本発のECパッケージではないので、日本のゲートウェイがデフォルトでバンドルされていないのが痛いところです。
エクステを使えばできるようですが、支払いって、ECで一番重要な箇所なので極力リスクを減らしたい！！。なので、私なら日本でも使えるPaypalを選びます。
Paypalを利用する場合にかかる費用は、月額利用料とトランザクション手数料の２つです。
Paypalの料金表
大多数の人は、「クレジットカード支払い」と「銀行振り込み」と「代引き支払い」の３つを選択すると思いますが、特に設定は難しくないので、詳細な説明は省きます。